En el reinicio de actividades del Instituto Científico y Literario de San Luis Potosí, varios profesores participaron combinando la cátedra con su labor de investigación profesional. Entre ellos, destaca la cátedra de física, impartida por Francisco Javier Estrada, quien tuvo varias aportaciones que lo reconocieron como el físico mexicano más importante del siglo XIX. La Universidad a lo largo del tiempo ha trabajado en proyectos de investigación científica, con una historia de constantes conflictos, pero también descubrimientos.
